Tähistame rahvusvahelist doktorantide päeva

Tänavu mais tähistatati esmakordselt Euroopa doktorantuuri päeva, et tõsta esile doktorantide rolli teaduse ja ühiskonna arengus. Selle raames saame tuttavaks arvutusliku genoomika nooremteadur Erkin Alaçamlı.

Erkin on tippkeskuse arheogenoomika töögrupi liige. „Oma teadustöös kasutan vana DNA-d, et avada seni väheuuritud rauaaja ja keskaja Eesti kogukondade varjatud lugusid ning luua seoseid mineviku ja tänapäeva vahel. Arheogenoomika – arheoloogilisest materjalist pärineva geneetilise informatsiooni uurimine – võimaldab vaadata kaugemale arheoloogilistest leidudest ning aitab mõista mineviku rahvastike päritolu, sotsiaalseid struktuure ja ajas kujunenud seoseid,“ kirjeldab ta.

Erkini sõnul ühendab arheogenoomika endas nii tehnilise andmeanalüüsi kui ka võimaluse rekonstrueerida mineviku inimeste lugusid, mistõttu on selles valdkonnas olulised analüütiline mõtlemine, uudishimu ja kannatlikkus.

Arheogenoomikani jõudis Erkin tänu oma magistritööle, mille raames töötas ta välja uuendatud versiooni READ-ist — ühest enimkasutatavast tööriistast muistsete indiviidide sugulussidemete tuvastamiseks.

Erkini arendatud READv2 muutis analüüsi kiiremaks ja lisas võimalusi muistsete kogukondade põhjalikumaks uurimiseks. Tegemist on valdkonnas laialdaselt kasutatava tööriistaga, mis võimaldab rekonstrueerida eelajaloolisi perekonnastruktuure. Samuti aitab see uurida, kas kõrgem staatus kandus edasi põlvkondade kaupa, kas abiellumise järel liikusid kogukondade vahel rohkem naised või mehed või kas samasse hauda maetud inimesed olid omavahel bioloogiliselt seotud.

Loe READv2 kohta teadusartiklist:
https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-024-03350-3