5. Funktsionaalne genoomika

Funktsionaalne genoomika on molekulaarbioloogia haru, mis püüab genoomide sekveneerimisest saadud andmeid geenide ja valkude funktsioonide ning interaktsioonide kohta muuta kasutatavateks.

Funktsionaalse genoomika uurimisvaldkonnad:

• Geeni transkriptsioon
• Translatsioon
• Valk – valk interaktsioonid

Funktsionaalne genoomika keskendub DNA funktsioonile geenide, RNA transkriptide ja valkude tasemel.  Iseloomulik on ülegenoomne lähenemine püstitatud küsimustele, meetoditena kasutatakse tavaliselt high – throughput metoodikat ja bioinformaatikat.

Pearõhk uuringutes asetub geeniekspressiooni mustrite erinevustele erinevates tingimustes.

Millal ja kus geenid ekspresseeruvad? Kuidas erineb geeniekspressiooni tase erinevates rakutüüpides ja kudedes?

Skeem konvergentsete (lähedaste liikide) uuringute kohta funktsionaalses genoomikas. QTL – quantitative trait loci; CNV – copy number variation. http://www.neurophenomics.info/cfg.php

Kirjandus:

• http://www.csm.ornl.gov/SC98/genomics.html 
• http://en.wikipedia.org/wiki/Functional_genomics
• http://www.ebi.ac.uk/training/online/course/functional-genomics-introduction-ebi-resources/what-functional-genomics