{"id":11,"date":"2024-04-04T04:32:24","date_gmt":"2024-04-04T01:32:24","guid":{"rendered":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/genoomiandmete-referentsbaas\/"},"modified":"2026-01-22T13:08:26","modified_gmt":"2026-01-22T11:08:26","slug":"genoomiandmete-referentsbaas","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/genoomiandmete-referentsbaas\/","title":{"rendered":"Genoomiandmete referentsbaas"},"content":{"rendered":"<p data-start=\"277\" data-end=\"559\">Genoomiandmete referentsbaasi haldab ja arendab Eesti biokeskus. Referentsbaas koondab laia geograafilise ulatusega kaasaegsete inimeste ja suure ajalise katvusega vana DNA genoomiandmeid erineva kultuuritaustaga populatsioonidest. <span style=\"font-size: revert;\">Genoomiandmete referentsbaas on avatud uuringuteks rahvusvahelisele teadlaskonnale. Andmekogu v\u00f5imaldab teadlastel uurida geneetilise varieeruvuse kujunemist fokusseeritult Kirde-Euroopa, sh Eesti, aladel.\u00a0<\/span><\/p>\n<p data-start=\"561\" data-end=\"830\">Genoomiandmete referentsbaasi arendamine on toimunud etapiviisiliselt. Esmalt loodi ruumiline referentsbaas, mis koondab eri geograafilistest piirkondadest p\u00e4rit populatsioonide genoomiandmeid. Ruumiline referentsbaas annab Eesti genoomikakeskusele rahvusvahelise m\u00f5\u00f5tme, v\u00f5imaldades geneetilist varieeruvust vaadelda geograafilises kontekstis.<\/p>\n<p data-start=\"561\" data-end=\"830\">J\u00e4rgmise etapina valmis temporaalne referentsbaas, mis katab vana DNA andmete abil Eesti ja l\u00e4hi\u00fcmbruse ajaliselt mesoliitikumist kuni t\u00e4nap\u00e4evani. \u00dchtlasi sisaldab andmebaas eri ajalise s\u00fcgavuse ja geograafilise katvusega proove Euroopast ning kaugemaltki. Genoomiandmed on sekveneeritud arheoloogiliselt h\u00e4sti kirjeldatud leiukohtadest p\u00e4rit inims\u00e4ilmetest. Temporaalne m\u00f5\u00f5de t\u00e4iendab genoomiandmete ruumilist vaadet ja v\u00f5imaldab k\u00e4sitleda geneetilise varieeruvuse muutumist ajas.<\/p>\n<p class=\"wp-block-heading\"><span style=\"font-size: revert;\">Aastatel 2025\u20132029 on teadustaristu teekaardi rahastuse raames kavas rikastada Eesti biokeskuse genoomiandmete referentsbaasi uute metagenoomika-, proteoomika- ja dateerimisalaste andmekihtidega ning parandada referentsbaasi \u00fchilduvust sidusvaldkondade andmestikega<\/span><\/p>\n<p>Referentsbaasi avaldatud andmed on k\u00e4ttesaadavad:<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/evolbio.ut.ee\">Eesti biokeskuse uuringute andmepesas<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/www.ebi.ac.uk\/ena\/data\/search?query=PRJEB12437\">European Nucleotide Archive andmebaasis<\/a><\/li>\n<\/ul>\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\"><br>Kontakt<br><\/h2>\n\n\n\n<p><strong>Eesti biokeskus<\/strong><br><br><a href=\"https:\/\/genomics.ut.ee\/et\/eesti-biokeskus\">https:\/\/genomics.ut.ee\/et\/eesti-biokeskus<\/a><br>info.genoomika@ut.ee<\/p>\n\n\n\n<p><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Genoomiandmete referentsbaasi haldab ja arendab Eesti biokeskus. Referentsbaas koondab laia geograafilise ulatusega kaasaegsete inimeste ja suure ajalise katvusega vana DNA genoomiandmeid erineva kultuuritaustaga populatsioonidest. Genoomiandmete referentsbaas on avatud uuringuteks rahvusvahelisele teadlaskonnale. Andmekogu v\u00f5imaldab teadlastel uurida geneetilise varieeruvuse kujunemist fokusseeritult Kirde-Euroopa, &#8230;<\/p>\n","protected":false},"author":154,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"inline_featured_image":false,"footnotes":""},"class_list":["post-11","page","type-page","status-publish","hentry"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/11","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/users\/154"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11"}],"version-history":[{"count":11,"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/11\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":247,"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/11\/revisions\/247"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/sisu.ut.ee\/genoomikakeskus\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}