TÜ Eesti Geenivaramu sekveneerimise- ja genotüpiseerimise tuumiklabor

TÜ Eesti Geenivaramu sekveneerimise- ja genotüpiseerimise tuumiklabor

TÜ Eesti Geenivaramu (TÜ EGV) tuumiklabor alustas tööd 2006. aastal ja tänaseks on genotüpiseerimise ja sekveneerimise tuumiklabori kasutuses Illumina uusim tehnoloogia.
Kasutusel olev maailma tipptasemel aparatuur võimaldab kaasaegset DNA ja RNA analüüsi.

Tuumiklabor pakub oma teenuseid nii Eestis kui välismaal asuvatele teadus- ja meditsiiniasutustele. Suuremad kliendid väljaspool Tartu ülikooli on siiani olnud Soomest, Hollandist, Inglismaalt ja Venemaalt. 2013. aastal omandas tuumiklabor Illumina CSPro (Certified Service Provider) sertifikaadi nii genotüpiseerimises, geeniekspressioonis kui ka sekveneerimises. See tagab kõrge kvaliteediga laboritöö, usaldusväärsed tulemused ja kiire teeninduse.

Pakutavad teenused

Illumina HiScanSQ võimaldab kiibipõhist üle-genoomset SNP genotüpiseerimist, geeniekspressiooni ning DNA metülatsiooni analüüsi.

Tuumiklabori poolt pakutavate genotüpiseerimisteenuste hulka kuuluvad kõik Illumina poolt pakutavad genotüpiseerimiskiibid ja genoomi metülatsioonimustrite määramist võimaldavad kiibid.

Meie teise põlvkonna sekveneerimise masinapark võimaldab kasutada kõiki Illumina poolt pakutavaid rakendusi.

Tuumiklabori poolt pakutavad sekveneerimisteenused hõlmavad:

  • kogu genoomi sekveneerimine (sh single-readpaired-end ja mate-pair järjestused),
  • suunatud ehk huvipakkuvate alade sekveneerimine (nt eksoom, vähi geenid, kaasasündinud haiguste geenid, rRNA geenid jms),
  • kogu transkriptoomi ehk RNA sekveneerimine,
  • valku kodeeriva mRNA sekveneerimine, valk-DNA interaktsioonide sekveneerimine (ChIPseq), bisulfit tehnoloogiaga sekveneerimine DNA metülatsiooni analüüsiks (sh kogu DNA või huvipakkuvate regioonide sekveneerimine),
  • mikrobioomi sekveneerimine ehk erinevate organite (nt soolestiku või naha) või keskkonna bakterikoosluste määramine
  • PCR produktide või amplikonide sekveneerimine

HiSeq2500

HiSeq2500

on võimas teise põlvkonna sekvenaator kahe eri mooduliga, mis suudab analüüsida korraga suurel hulgal proove.

MiSeq

MiSeq

on põhiliselt väiksemate genoomide (mikroorganismid) kiireks ning lihtsaks protsessimiseks.

HiScanSQ

HiScanSQ

on genotüpiseerimise, metülatsiooni ning ekspressiooni kiipide analüüsiks.

 

Täpsemat informatsiooni erinevate teenuste kohta leiab tuumiklabori inglisekeelsel kodulehel.

Kontakt

TÜ Eesti Geenivaramu tuumiklabor

Riia 23b, Tartu 51010
Estonia

Phone: +372 737 5029
Email: corefacility@ut.ee
Web: www.geenivaramu.ee/en/