Eesti genoomikakeskus

Eesti genoomikakeskus (EGK) on riikliku tähtsusega teadustaristu, mille moodustavad populatsioonipõhine biopank (Eesti geenivaramu), genoomiuuringuteks vajalik taristu (genoomika instituudi tuumiklabor), Eesti biokeskuse genoomiandmete referentsbaas ning rahvastiku kujunemise, bioinformaatika ja statistika-alane teaduslik kompetents.

Keskus loodi 2010. aastal ja on sellest ajast alates olnud osa Eesti teadustaristu teekaardist. Eesti genoomikakeskus võimaldab läbi viia maailmatasemel genoomika- ja terviseuuringuid ning toetab interdistsiplinaarset teaduskoostööd loodus-, tervise-, sotsiaal- ja humanitaarteaduste valdkondades. Terviklik taristu hõlmab nii suuremahulisi ja kvaliteetseid andmestikke kui ka kiiret ja kompetentset genoomianalüüsi teenust – nii andmete tootmiseks kui ka nende statistiliseks ja bioinformaatiliseks töötlemiseks. Keskus on avatud uuringuteks rahvusvahelisele teadlaskonnale.

Eesti genoomikakeskus asub Tartus, Riia 23b, Tartu Ülikooli Omicumi teadushoones, kuhu on rajatud spetsiaalne taristu genoomiuuringute läbiviimiseks ja populatsioonipõhise biopanga haldamiseks. Mitme erineva rahastusmeetme raames soetatud maailmatasemel genoomianalüüsi aparatuur võimaldab tõhusalt ellu viia teadusprojekte ning pakkuda teenust nii Eesti kui ka välismaa teadusasutustele, laboritele, haiglatele ja ettevõtetele.

Struktuur

Eesti genoomikakeskuse osad:

• Eesti geenivaramu
• Genoomika instituudi tuumiklabor
• Eesti biokeskuse genoomiandmete referentsbaas

Juhtimine

Eesti genoomikakeskust haldab Tartu Ülikooli genoomika instituut (TÜ GI), mille tegevust reguleerib instituudi põhikiri. Keskuse tegevjuht on Eesti geenivaramu juht Lili Milani. Strateegilisel tasandil juhib keskuse tegevust nõukogu.

Eesti Genoomikakeskuse nõukogu liikmed:

Rahastus

Eesti genoomikakeskuse arendamist on aastate jooksul rahastatud mitme riikliku ja Euroopa Liidu rahastusmeetme kaudu. Sealhulgas on EGK olnud osa Eesti teadustaristu teekaardist alates selle esimesest koostamisest 2010. aastal ning kuulunud kõigi järgnevate teekaartide koosseisu (2014, 2019 ja 2024).

Teadustaristu teekaardi toetus on võimaldanud arendada Eesti geenivaramu andme- ja IT-taristut, kaasajastada genoomika tuumiklaborit ning täiendada genoomiandmete referentsbaasi. Rahastuse toel on keskuse fookus liikunud algsest taristu rajamisest selle sisulise rikastamise ja mitmekesisema kasutuse suunas, suurendades taristu kasutatavust ja teaduslikku mõju.

Loe lähemalt teadustaristu teekaardist Eesti Teadusagentuuri kodulehelt.

Eesmärgid 2025–2029

Eesti Teadusagentuur toetab Eesti genoomikakeskust kui riikliku tähtsusega teadustaristut aastatel 2025–2029 summas 1 720 000 eurot.

Teadustaristu teekaardi rahastuse raames on kavandatud järgmised tegevussuunad:

• Eesti geenivaramu IT-taristu arendamine, sh andmekoosseisu päringute keskkond, väljastuste menetlemise infosüsteem ja MinuGeenivaramu portaal
• Eesti geenivaramu andmekogu rikastamine mikrobioomi andmetega
• Eesti geenivaramu DNA-proovide hoiustamise ja väljastamise süsteemi kaasajastamine
• Genoomika tuumiklabori tööprotsesside automatiseerimine ja ISO 17025:2017 standardile akrediteeritud protsesside laiendamine
• Eesti biokeskuse genoomiandmete referentsbaasi rikastamine uute metagenoomika-, proteoomika- ja dateerimisalaste andmekihtidega
• Eesti biokeskuse genoomiandmete referentsbaasi ühilduvuse parandamine sidusvaldkondade andmestikega