Genoomiandmete referentsbaas

Genoomiandmete referentsbaasi haldab ja arendab Eesti biokeskus. Referentsbaas koondab laia geograafilise ulatusega kaasaegsete inimeste ja suure ajalise katvusega vana DNA genoomiandmeid erineva kultuuritaustaga populatsioonidest. Genoomiandmete referentsbaas on avatud uuringuteks rahvusvahelisele teadlaskonnale. Andmekogu võimaldab teadlastel uurida geneetilise varieeruvuse kujunemist fokusseeritult Kirde-Euroopa, sh Eesti, aladel. 

Genoomiandmete referentsbaasi arendamine on toimunud etapiviisiliselt. Esmalt loodi ruumiline referentsbaas, mis koondab eri geograafilistest piirkondadest pärit populatsioonide genoomiandmeid. Ruumiline referentsbaas annab Eesti genoomikakeskusele rahvusvahelise mõõtme, võimaldades geneetilist varieeruvust vaadelda geograafilises kontekstis.

Järgmise etapina valmis temporaalne referentsbaas, mis katab vana DNA andmete abil Eesti ja lähiümbruse ajaliselt mesoliitikumist kuni tänapäevani. Ühtlasi sisaldab andmebaas eri ajalise sügavuse ja geograafilise katvusega proove Euroopast ning kaugemaltki. Genoomiandmed on sekveneeritud arheoloogiliselt hästi kirjeldatud leiukohtadest pärit inimsäilmetest. Temporaalne mõõde täiendab genoomiandmete ruumilist vaadet ja võimaldab käsitleda geneetilise varieeruvuse muutumist ajas.

Aastatel 2025–2029 on teadustaristu teekaardi rahastuse raames kavas rikastada Eesti biokeskuse genoomiandmete referentsbaasi uute metagenoomika-, proteoomika- ja dateerimisalaste andmekihtidega ning parandada referentsbaasi ühilduvust sidusvaldkondade andmestikega

Referentsbaasi avaldatud andmed on kättesaadavad:

• Eesti biokeskuse uuringute andmepesas
• European Nucleotide Archive andmebaasis

Kontakt

Eesti biokeskus

https://genomics.ut.ee/et/eesti-biokeskus
info.genoomika@ut.ee