Eesti genoomikakeskus kui osa Eesti teadustaristust

Eesti genoomika arengu jätkamiseks loodi 2010. aastal Tartu Ülikooli Eesti geenivaramu (TÜ EGV) ja Eesti Biokeskuse (EBK) baasil Eesti genoomikakeskus (EGK), mis hõlmas nii populatsioonipõhist biopanka, genoomiuuringuteks vajalikku taristut (sh tuumiklabor), bioinformaatika ja statistika alast teaduslikku kompetentsi ning Eesti Biokeskuse genoomiandmete referentsbaasi. TÜ Eesti geenivaramu on ESFRI teekaardi objekti, Euroopa biopankade ja biomolekulaarressursside teadustaristu BBMRI-ERIC partner ja ühtlasi täidab selles Eesti node’i ülesandeid. TÜ EGV ja Eesti Biokeskuse liitumine ühtseks TÜ genoomika instituudiks toimus 1. jaanuaril 2018. Uue instituudi loomise tulemusena liideti samuti seni eraldi eksisteerinud TÜ EGV tuumiklabor ja EBK tuumiklabor ühtseks TÜ GI genoomika tuumiklaboriks.

Taustainformatsioon

EGK taristu eesmärgiks on tagada Eesti teadus- ja arendustegevuse vajadused genoomianalüüsi ning terviseuuringute osas, sh konkurentsivõimeliseks rahvusvaheliseks koostööks. Oluliseks ülesandeks Eestis on rikastada diagnostika- ja ravivõimalusi arendades ning juurutades personaalmeditsiini. 

EGVs on tänaseks üle 210 000 inimese koeproovid, oomika andmed ja terviseinfo. Kõigi 210 000 geenidoonori genoomid on analüüsitud ühel tehnilisel platvormil (Illumina GSA kõrgtiheda kiibiga).

EBK genoomiandmete referentsbaas koondab laia geograafilise ulatusega kaasaegsete inimeste ja suure ajalise katvusega vana DNA genoomiandmeid erineva kultuuritaustaga populatsioonidest, andes EGK infrastruktuurile erialade ülese ja rahvusvahelise mõõtme.

Eesti genoomikakeskus asub Tartus, Riia 23b (Omicumi majas), kus on suurepärased töötingimused ja spetsiaalselt genoomiuuringuteks ja populatsioonipõhise biopanga haldamiseks vajalik taristu.  Mitme erineva meetme raames soetatud maailmatasemel genoomianalüüsi aparatuur võimaldab kiirelt ja efektiivselt ellu viia teadusprojekte ja pakkuda teenust nii Eesti kui välismaa teadusasutustele ja laboritele, haiglatele ning ettevõtetele.

Oma infrastruktuuri (suuremahuline ja kvaliteetne andmestik, kiire ja kompetentne geenianalüüsi teenus nii andmete tootmiseks kui ka nende statistiliseks ja bioinformaatiliseks töötlemiseks) näol soovitakse pakkuda rakendusvõimalusi teadlastele väga paljudes teadussuundades – geneetikas, meditsiinis, farmakogeneetikas, sotsiaalteadustes, ökoloogias jne.

Partnerlus

Alates 2013. aastast on TÜ Eesti geenivaramu üleeuroopalise biopankade ja biomolekulaarressursside teadustaristu BBMRI-ERIC liige.